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由于最开始时，无论是省咨议院还是常设国民大会，其成员都没有选出，因此，第一届常设国民大会和第一届省咨议院的咨议员们全部是由林清华和他身边的亲信从数万名候选人中抽签选定的，当第一届常设国民大会和第一届各省咨议院的咨议员被选定之后，往后各届的咨议员则按照程序由咨议院和常设国民大会自行选举，而且每五年改选其中一半。
具体选举程序并不复杂，当候选人的资格认定结束，名单最终确定之后，将通过抽签的方式决定最终的人选，而负责抽签的人为三人，一为地方检察院的检察官，一为省高等法院的法官，而另一人则为上届常设国民大会或咨议院的议长，而且上一届常设国民大会或咨议院的全体成员将在一旁监督。抽签分组进行，分别按照各职业预定配额抽取，当军队的人员名单送来后，则咨议员的最终人选即可确定。
每隔五年的改选程序也同样采用抽签的方法进行，所有的成员全部参加抽签，而省高等法院将派人现场监督。签为红绿两签，抽到红签的人自动解除咨议员身份，而空缺出来的名额则按照职业比例在三个月内补齐，而在这期间，原咨议员暂时以代理身份履行职责。
常设国民大会的咨议员人数与咨议院的咨议员人数相同，均为两百人。常设国民大会负责制订全国性法律，而省咨议院则负责制订地方法令，这两者所制订的法律和法令必须通过三分之二咨议员的认可方可施行。
常设国民大会的咨议员与省咨议院的咨议员一样，都有固定生活补助，虽然不高，不过却能保证出身贫寒者能够在省府驻地正常生活。
与行省一样，边疆区的咨议院也是如此组建，但在某些方面，边疆区却另有一套自己的办法。
在行省中，省长与县长都是由通过科举产生的人才担任，具体由常设国民大会任命，但其若想上任，则必须得到省咨议院至少半数赞同票的支持，一旦其被咨议院允许上任，则连续任期为八年，在这八年中，每隔两年，省咨议院就对其任内政绩、廉洁等进行考核，若不合格，则咨议院可由议长主持，进行弹劾，当弹劾票达到一半时，即可罢免。
省、县官员被罢免后，若其本人不服，则可向常设国民大会直接提出复查申请，由常设国民大会派出调查组赴当地进行调查核实，若确有不妥，则由常设国民大会的代表主持，再次进行弹劾，若此次再被弹劾，则官员自动离任，但其若无违法行为，则其政府官员身份可以保留，并可继续等候上级政府新的任命。
若省、县主官能够连续任满八年任期，则由各省咨议院写出书面报告，将其政绩上报常设国民大会，再由常设国民大会决定是否将其提升，或者继续留任原职。省长、县长都只管理民政事务，而无其他管理权，即无权管理法律事务，也无权管理军事事务。
与行胜”，而是“总督”。总督的任命不需要边疆区咨议院的同意和表决，只要被任命，则直接上任，不过，有权任命总督的只有东帅一个人，除非遇到紧急情况，否则常设国民大会不能越级任命总督。边疆区的咨议院规模稍大，人数为三百人，其中一百人的名额是专门为当地土著预留的，这些人可以不认识汉字，但必须承认总督的权威。边疆区其它的行政事物与内地行省一致，县长也是由同样的选举程序产生。
总督的权限很大，除了管民政之外，还能够管当地驻军，实际上，总督就是当地的最高司令，他的军事命令在边疆区是最高命令，除非东帅、国防部或者是总参谋部下达了更高等级的命令，否则，边疆区总督的话就是当地军队唯一执行的命令。
总督唯一不能管的事情就是边疆区的法律。与其他行省一样，这里的法官也是独立的，其由常设国民大会从科举人才中选拔任命，并仅向常设国民大会负责。每个省仅设一个高等法院，而在每个县则各设一个地方法院，地方法院的案子可直接上诉至省高等法院，若仍对高等法院的审判结果不服，则原被告双方可继续上诉至国家的最高法院系统————终审法院，终审法院的判决为最终判决，但若原被告依然不服，则可继续向常设国民大会提出复核申请。
县级地方法院的审判由两名法官做出，只有两人意见一致的情况下，才能做出判决，而且在审判时，原被告双方的亲属朋友或者乡邻必须旁听，而且报社记者若想采访，任何法官都不得拒绝，除非是原被告双方的所有直系亲属同时拒绝。
省级高等法院的审判由三名法官做出，也只有在三人意见完全一致的情况下，才能做出判决。具体审判细节也与地方法院一致，而且作为必要的措施，高等法院每一个案子的审判，都必须要有至少三名省咨议院的咨议员旁听，而咨议院的任何一位咨议员都不能无故拒绝法院的旁听邀请。
终审法院的审判法官由十八名流动法院的法官共同组成，其人选由常设国民大会的议长和副议长共同选定，每届任期仅为一年，一年之后，更换其中一半。只有其中的至少十五名法官同意，判决才能下达。终审法院的数量未定，具体可根据上一年的案发率和结案率确定，可以只有一个终审法院，但也可以在某一年同时设立数十个终审法院。
流动法院是个特殊的法院系统，其职责不是审判案件，而是巡查全国各地的地方法院和高等法院，审查其审判的案子，并主动清查可能的冤案，一旦发现可能的冤案，即向上一级法院提起重审，其案自动进入重审程序。
所有的死刑判决都必须得到终审法院的审核和认定，否则不能执行。
作为法律的重要一环，负责提起刑事诉讼的检察官是必不可少的，但是，检察院与法院不一样的是，检察官不由常设国民大会任命，也不向其负责，检察院直接隶属于由刑部改来的司法部，仅向司法部负责，其检察官的任命由司法部单独从各法律、医学毕业生中遴选，也必须通过专门的考试，而且检察院不仅仅只在各省设立，在南京还设立一个总检察院，负责监督地方检察院。
作为法律的不可或缺的补充，律师也是必要的，在具体的辩护中，律师可以是专门的职业律师，也可以是被告的亲属或者朋友，但在今后的司法实践中，职业律师将最终取代平民辩护人的位置。
各级法院的法官与检察院的检察官一样，任期都是终身，除非其任职期间发生了渎职、违法行为，否则，其可以一直干到六十岁退休，而且其待遇是所有政府官员中最优厚的。
第三个重要革新是在军事体制上。根据林清华多年前的安排，国防部的前身兵部早就开始了军制的改革，除了在各部队中正式确立参谋制度之外，还在国防部中设立总参谋部，直接隶属于国防部，但又不完全听命于国防部，其可以由东帅与国防部共同领导，但两方的命令发生冲突时，则仅执行东帅命令。
总参谋部具体负责军事行动的策划、制订和实施，其在战争中具有相当大的独立性，可以将国防部的错误命令直接发回国防部，并指出错误，同时抄送一份至东帅处。
军队的驻扎、调动方式也发生了变化，在各行省中，固定的“军”被取消，部队的最大常设单位为“师”，而且其直接受到国防部的指挥，没有东帅和国防部的共同命令，总参谋部无法调动陆军和海军部队，其唯一能独自调动的只有两栖部队，而东帅则有超越国防部的权利，可以任意调动任何一支部队。
当得到国防部或者是东帅的命令后，总参谋部才可以调动部队，并且根据行动的性质，将零散的师整编到一起，或者编为军，或者直接编为集团军，任命军长、司令，指定参谋组成参谋部，并向目标地域开进。在这种时候，原来由国防部指挥的后勤部门则直接由总参谋部领导，并向其负责，提供一切后勤支援。
而边疆区的军事体制则与行省不一样，由于这里靠近国境线，不能有丝毫的松懈，因此，这里的军事体制由安全向效率倾斜。在这里，部队的最大常设单位可以是军，也可以是集团军，这由当地的总督决定。军的军长或者是集团军的司令由当地总督任命，但是，为了防止总督拥兵自重，这些部队的师长、旅长、团长和中下级军官以及部队的参谋人员由国防部直接任命，而且总督不能将其罢免，但部队主官要绝对服从总督的命令，除非总督命令自己向内地行省开进，或者其下达的命令违法，否则军队主官不能拒绝服从命令。更为重要的手段是，每隔三年时间，国防部将把边疆区的部分部队进行换防，或者与别的边疆区对调，或者与内地部队对调，总之，要既能保持当地部队的有效战斗力，也要能够有效防止藩镇出现。
另外，出于军事准备的需要，在地方预备役部队镇戍军中，开始试行义务兵役制，服役时间暂定为三年。
为了严肃军纪，军事检察院和军事法庭也正式永久设立，遇到现役军人犯罪的案子，地方法院不能审理，而由军事法庭进行审理，而且被告一旦被定罪，其只能向终审法院提起上诉。
第四个改革措施是关于各部部长的任命。部长的任命完全由东帅一人决定，无需通过常设国民大会的认可，任期为六年，但是，每过两年，常设国民大会便会对各部部长进行一次政绩考核，若其不称职，则可以自动发起弹劾程序，一旦弹劾通过，则由议长向东帅提出重新任命的建议，而东帅也必须另换人选，继续剩下的任期，但此人的上任就必须得到常设国民大会半数赞成票的支持，否则不被认可，而且将由常设国民大会自行选出一人担任此职，直到此届任期结束。
第五个改革措施为财政方面。由常设国民大会与财政部共同组成预算小组，试着进行国家财政预算的制订，但这个小组暂时没有财政决定权，其权利暂时仍旧掌握在东帅与财政部手中。
第六个改革措施为情报系统的改革。作为最为有效率的情报组织，青衫社继续完善本身的组织体系，而且其被分割为两个不相统属的部分，青衫左社改名为国家情报局，主管国内及国外情报收集和整理，并监视内部敌人。青衫右社改名为军事情报局，主管军事情报的收集与整理，并向国外发展情报人员。国家情报局隶属于财政部，其资金来源由财政部全权负责，而军事情报局则受到财政部与国防部的双重领导，资金来源于财政部，而人员与行动则由国防部属下的总参谋部指挥。
第七个改革措施是关于民械管理的。由于边疆区面临的威胁较大，而且边疆形势复杂多变，因此，边疆区的民间枪械管理与内地行省略微不同。根据林清华的行政划分，边疆区一共有五个，分别是：北部，以北纬六十五度为界，以北为北极边疆区；西部，以石头山为界，以西为靖西边疆区；南部，以喜玛拉雅山南麓为界，以南为恒河边疆区；东部，包括日本列岛，以及美州的巴拿马等地区在内，为太平洋边疆区；西南部，中亚一带，为河中边疆区。
为了抵抗可能的入侵，并保障当地民兵的战斗力，边疆区的所有能够讲汉语或者能够写汉字的国民都可以拥有后装枪，但其枪长必须超过